Efter sin långa tjänst för Arsenal så gick karriären vidare till Manchester City, i juli 2009 tecknade han ett femårigt kontrakt med dem. Överföringssumman sägs ha varit runt 25 miljoner pund.
Han gjorde ett mål i sin debut för City mot Blackburn, med ett skott från 18 meter i den tredje minuten. Vid hemmadebuten nätade Adebayor i 17:e minuten mot Wolverhampton Wanderers.